Cómo afecta una variante a la proteína
Variantes y mutaciones · Nivel intermedio · 2 min de lectura
En una frase: según cómo alteren la lectura de tres en tres letras, las variantes de un gen pueden ser silenciosas, cambiar un aminoácido, introducir una parada prematura o desplazar toda la lectura.
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Silenciosas (sinónimas)
Cambian una letra pero el codón sigue significando el mismo aminoácido, gracias a la redundancia del código genético. Casi nunca tienen efecto, aunque algunas alteran el splicing.
De cambio de sentido (missense)
El codón pasa a significar otro aminoácido. El efecto depende de cuánto se parezcan los dos aminoácidos y de dónde caiga el cambio: en una zona sin importancia puede no notarse; en el centro activo de una enzima, anularla. La anemia falciforme se debe a un cambio de sentido en la hemoglobina beta (ácido glutámico por valina).
Sin sentido (nonsense)
El cambio crea un codón de parada antes de tiempo. La proteína sale truncada y, muy a menudo, el ARN mensajero ni siquiera llega a traducirse porque la célula lo detecta y lo destruye, un mecanismo de control de calidad.
De desplazamiento del marco de lectura (frameshift)
La pérdida o ganancia de letras en un número que no es múltiplo de tres descoloca todos los codones siguientes. La proteína resultante es distinta desde ese punto y suele cortarse pronto.
De splicing y reguladoras
Algunas variantes no cambian ningún codón, pero alteran las señales de corte y empalme y hacen que se pierda un exón o se incluya un trozo de intrón. Otras, fuera del gen, cambian cuánto se fabrica de una proteína normal.
Pérdida o ganancia de función
Más allá del tipo, importa el resultado. La mayoría de las variantes patogénicas causan pérdida de función: la proteína no funciona o no se fabrica. Otras causan ganancia de función: la proteína trabaja de más o hace algo nuevo, como en muchos oncogenes. Esta distinción ayuda a entender si una enfermedad se hereda de forma dominante o recesiva.
Ideas clave
- Las variantes silenciosas no cambian el aminoácido.
- Las de cambio de sentido cambian un aminoácido por otro.
- Las sin sentido y las de desplazamiento del marco suelen truncar la proteína.
- Algunas variantes actúan alterando el splicing o la regulación del gen.
Preguntas frecuentes
Suele causar pérdida de función, pero que sea grave depende del gen: en muchos genes, perder una copia no tiene consecuencias.
Con programas que valoran la conservación evolutiva y el tipo de aminoácido, y cada vez más con modelos de inteligencia artificial; pero la confirmación requiere estudios funcionales o clínicos.
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Fuentes
Imagen de cabecera: Nik.vuk, Wikimedia Commons (CC BY-SA 4.0), recortada.